生物医学研究一直致力于开发基于肽和蛋白质的新治疗方法，通过引入结构和功能特定的修饰，并保持与生物活性相关的特征 - peptidomimetics。从这个角度来看，肽和蛋白质被视为发现其他类化合物的工具。拟肽是有机分子，模拟天然肽或蛋白质的作用，旨在克服与天然肽相关的问题，并改善其他特性，如增强的受体亲和性和选择性、效力和良好的生物利用度。因此，拟肽的设计和合成无疑在药物发现中具有巨大潜力。

库设计 在Life Chemicals，我们开发了不同的合成策略来调节拟肽化合物的构象灵活性和肽特性。可以引入非天然氨基酸（如β-氨基酸、丙氨酸衍生物等）和氨基醇基团到拟肽骨架中。合成化合物可以作为肽二级结构的模拟体（α-螺旋、β-转角和β-链）。这种方法包括各种相似性分析技术，如与已知拟肽抑制剂和骨架的结构相似性搜索、三维形状筛选、药效团筛选和复杂亚结构搜索：

1. 对已知的拟肽抑制剂和骨架进行了二维相似性分析，Tanimoto指数≥ 0.8
2. 使用Pharmacophore Types体积评分对Life Chemicals HTS化合物库生成的100万个构象进行了三维形状筛选。筛选基于α-螺旋和β-转角（类型I和II）的三维结构，这些结构是通过量子力学计算获得的。
3. 药效团筛选包括基于通过量子力学计算获得的β-转角（类型I和II）的三维结构的药效团模型构建。该模型包含特定的排除体积约束和给体/受体原子位置，以允许β-转角模拟体中的氢键形成。
4. 复杂亚结构搜索涉及基于文献中α-螺旋和β-转角peptidomimetic骨架构建的搜索查询，如各种双环、螺环、大环、吡咯烷、苯基、烯酰胺、蒽烯