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lipoxygenase_library
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脂氧合酶靶向化合物库
Lipoxygenase Library From Enamine
产品编号: EN3400

Lipoxygenases (LOXs)是一类酶,它们催化多不饱和脂肪酸(如亚油酸或花生四烯酸)生成相应的过氧化物。LOXs 广泛表达于免疫、上皮和肿瘤细胞中,激活这些酶会引起许多结构和代谢变化。异常的LOX 活性与多种病理生理条件有关,包括炎症、皮肤疾病和肿瘤发生。

脂氧化酶库包含1388个化合物。

https://enamine.net/compound-libraries/targeted-libraries/lipoxygenase-library

陶术生物的所有产品和服务仅用于科学研究,我们不为任何个人用途提供产品和服务。
产品编号:EN3400

Enamine的1,388个化合物脂氧化酶库采用了两种不同的方法进行设计:

  1. 基于分子对接的计算筛选,在此过程中鉴定了来源于新颖骨架的化合物。
  2. 使用2D线性指纹和3D药效团特征进行相似性搜索,得到具有新侧链的分子。

分子对接 对接模型是基于PDB报道的蛋白质结构3O8Y、4NRE和3D3L构建的。在进行对接之前,所有结构都经过了优化和重构,以修复缺失的侧链和间隙。与Fe3+离子配位的水分子受限,并且其电离状态被分配。每个对接模型包含了结合位点的静电描述符和强制的位置约束。

通过对Enamine整个库存集合(超过2.3百万化合物)的1百万种经过药物化学精炼的亚库进行筛选,使用的对接模型进行了筛选。命中物的定义是具有位置约束的必需对齐 - 金属配位(红色)和疏水中心(橙色)。对接结果通过对比对接得分和可视化结合位构象(氢键的存在、暴露程度)进行评估,最终得到950个化合物。

相似性搜索 通过对ChEMBL数据库进行针对脂氧化酶靶向的搜索,得到了针对三种脂氧化酶类型(A5、A12、A15)的322个活性化合物的参考集合。这些化合物进一步使用功效值(IC50 ≤ 1μM)和药物化学毒理药效团进行过滤。

使用线性指纹和Tanimoto算法进行0.85阈值的2D相似性搜索。

从Enamine的筛选库中选择了近500个化合物,并将其添加到LOX库中。

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化合物库组成
化合物库信息示例
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Vadadustat TAK875 TAK-779 Tegobuvir RN-1734 BMS-687453 AM211 FT011 BMS754807 AAI101
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RPW-24 SRT1720 hydrochloride INH6 SRT 2183 AMG208 Pentadecanoic acid Apiopaeonoside Pemirolast potassium L-Anserine nitrate salt Sodium Picosulfate
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Lercanidipine Cobicistat 1-Ethyl-2-benzimidazolinone ROSIRIDIN PF-AKT400 Benzyl alcohol 1-Methylnicotinamide chloride MX69 CVT-10216 LCL161
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Tirasemtiv Roniacol Rg3039 Z433927330 Desloratadine CH5132799 5-Bromoindole Smurf1-IN-A01 Halosulfuron-methyl Piceatannol
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ML346 SB 4 Daclatasvir Daclatasvir dihydrochloride NADPH (tetracyclohexanamine) AZD8055 Vistusertib PAβN dihydrochloride HZ1157 Rotundine
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Thiamet G B-AP15 Silmitasertib Levofloxacin Pamicogrel GSK369796 Dihydrochloride 2-Chloronaphthoquinone TFAP Tenovin3 Azvudine
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Milnacipran hydrochloride BW-A78U Tenovin-6 DL-Normetanephrine hydrochloride Triclocarban CUDC101 Chlorpropham Mestinon Zacopride hydrochloride PF04691502
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L-Hyoscyamine Noreugenin ML-030 BC-1382 Gadolinium chloride Vorolanib VTP-27999 TFA GSK0660 Lomerizine hydrochloride 8-CHLOROQUINAZOLIN-4(1H)-ONE