分子形状是生物分子识别和与结合位点的亲和性之间的重要因素之一。然而，绝大多数现有药物都以富含sp2的芳香核为中心。此外，通常可以在多种针对不同疾病的药物中找到相同的核心基团，这导致了低特异性（选择性）和副作用的增加。尽管大多数片段库提供了高水平的多样性，并且经过精细调整以包含正确的属性平衡，但它们在形状多样性方面往往具有局限性。鉴于上述情况，我们精心设计了我们的3D 片段库，使用可以评估分子的3D维度和多样性的物理化学性质和描述符。

库设计 首先，使用几个过滤标准应用于Life Chemicals General Fragment库的Rule of Three。主惯性矩（PMI）计算被用作一种高效的方法来计算和评估3D维度。通过应用最大Tanimoto多样性系数85％（使用线性指纹），证明了库的适当多样性水平。通过应用PAINS和我们独有的内部药物化学过滤器，消除了不良的功能基团。总共选择了约3,100个可供使用的片段，代表了各种3D形状的分子。