G-四链体是基因组中由重复的鸟嘌呤束形成的高阶四链结构。尽管 DNA G-四链体比 RNA 更普遍，但 RNA 四链体在各种生物过程中仍然至关重要，例如表观遗传调控、端粒维持、线粒体 RNA 表达等。我们分析了所有已报道的 RNA G-四链体 (G4s) 结构，并基于 RNA 适体和 h-MYC G4s 建模创建了 6 个对接模型。

核糖开关是 mRNA 的细菌调节片段，由代谢物结合适体和表达平台组成。它们对于不同的过程至关重要：病毒基因的表达、基因调节功能、mRNA 编码的蛋白质的产生控制、催化反应、与其他 RNA 或调节大分子结合等等。鉴于哺乳动物细胞中不存在核糖开关，它们成为发现新抗菌药物的非常有吸引力的靶标。已经创建了 20 多个对接模型，用于以下核糖开关的计算机筛选：2-脱氧鸟苷、c-di-AMP、c-di-GMP、I 类 PreQ1、FMN、具有 G40A 突变的 glmS 核酶、谷氨酰胺 II、甘氨酸、鸟嘌呤、L-谷氨酰胺、赖氨酸、metY SAM V、preQ1 II 类、PreQ1、PRPP、s-腺苷同型半胱氨酸、SMK 盒 (SAM-III)、THF、thi-Box、thi-M、ZTP 核糖开关。

RNA 剪接调控可能是真核药物发现中最有吸引力的。调节 RNA 剪接将是治疗癌症和遗传疾病最有效的方法之一。我们专注于靶向调节和前体 mRNA 和激酶，这些活性是 RNA 剪接所必需的：富含丝氨酸和精氨酸的剪接因子蛋白激酶 SRPK 和 CDC2 样激酶 CLK。

基于结构的方法（分子对接）已被用作文库构建的主要技术。分析了 RNA G4、核糖开关、mRNA 和 SRPK 和 CLK 激酶的所有可用 PDB 结构。选择了独特的“蛋白质-配体”复合物进行进一步分析和对接模型构建。G4 使用以下 PDB 结构：6C63、6e81、6E81、6E8S、7oa3、8EYV；和核糖开关：2hom、2miy、3b4b、3d0u、3e5e、3irw、3npn、3p49、3q50、3ski、4lvy、4nya、4nyb、4nyd、4qk8、4rzd、5c45、5ddq、6ck4、6fz0、6p2h、6qn3、6uc8、6uc9、6wzs。