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3_phosphoinositide_dependent_kinase_1_(pdk1)_targeted_library
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PDK1靶向化合物库
3-Phosphoinositide-Dependent Kinase-1 (PDK1) Targeted Library
产品编号: LF4000

PDK1(3-磷脂酰肌醇依赖性蛋白激酶-1)在胰岛素和生长因子信号级联中起着重要作用。已知它能磷酸化并激活至少24种属于 AGC(cAMP 依赖性、cGMP 依赖性、蛋白激酶 C)家族蛋白激酶的蛋白质。许多研究致力于理解这些 AGC 激酶在癌症及随后的胰岛素和生长因子刺激中的活化机制。PDK1抑制剂可能为开发有效的治疗药物提供新的机会。3-磷脂酰肌醇依赖性蛋白激酶-1(PDK1)靶向库中的化合物总数约为760个。

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产品编号:LF4000

尤其重要的是,几乎半数的常见人类肿瘤类型,包括乳腺癌、肺癌、胃癌、前列腺癌、血液系统肿瘤和卵巢癌,在调控PIP3产生的基因中具有突变,导致PDK1过度刺激和AGC激酶的活化。PDK1抑制剂在体外和体内对癌细胞生长的影响表明,PDK1是一个有效的药物靶点。累积的证据表明,PDK1是一个有前途的治疗靶点,其抑制可能有助于防止癌症的进展和异常组织扩散。 大多数已描述的PDK1抑制剂是ATP竞争性抑制剂,靶向激酶的ATP结合位点。我们分析了十个PDK1抑制剂复合物的PDB结构,并选择在1UU3 PDB条目中记录的结构,以进行潜在抑制剂在Life Chemicals库化合物集中的计算筛选。根据负责蛋白质-配体相互作用的残基特征(Ala162、Ser160、Thr222、Val143、Glu166负责极性相互作用的残基;Leu159、Leu212、Thr222、Val143、Tyr170的疏水区域),构建了蛋白质结合位点的筛选模型。结合位点的查询模型是在UNITY Application(SYBYL-X)中准备的,包括给体、受体和2个疏水位点以及表面体积约束。使用UNITY Flex Search工具对准备的分子集进行虚拟筛选。最终的命中化合物集是通过QFit评分函数进行选择的。

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化合物库组成
化合物库信息示例
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RPW-24 SRT1720 hydrochloride INH6 SRT 2183 AMG208 Pentadecanoic acid Apiopaeonoside Pemirolast potassium L-Anserine nitrate salt Sodium Picosulfate
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Tirasemtiv Roniacol Rg3039 Z433927330 Desloratadine CH5132799 5-Bromoindole Smurf1-IN-A01 Halosulfuron-methyl Piceatannol
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ML346 SB 4 Daclatasvir Daclatasvir dihydrochloride NADPH (tetracyclohexanamine) AZD8055 Vistusertib PAβN dihydrochloride HZ1157 Rotundine
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Thiamet G B-AP15 Silmitasertib Levofloxacin Pamicogrel GSK369796 Dihydrochloride 2-Chloronaphthoquinone TFAP Tenovin3 Azvudine
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L-Hyoscyamine Noreugenin ML-030 BC-1382 Gadolinium chloride Vorolanib VTP-27999 TFA GSK0660 Lomerizine hydrochloride 8-CHLOROQUINAZOLIN-4(1H)-ONE